# STOCKHOLM 1.0
#=GF ID   DUF4084
#=GF AC   PF13321.1
#=GF DE   Domain of unknown function (DUF4084)
#=GF AU   Mistry J, Aldam G
#=GF SE   Pfam-B_2026 (release 24.0)
#=GF GA   22.00 22.00;
#=GF TC   23.40 23.20;
#=GF NC   20.80 20.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Domain_of_unknown_function
#=GF DR   INTERPRO; IPR025152;
#=GF CC   This family of Firmicute proteins is frequently associated with
#=GF CC   the EAL, GGDEF and PAS families, Pfam:PF00563, Pfam:PF00990, and
#=GF CC   Pfam:PF00989. The exact function is not known.
#=GF SQ   8
#=GS Q4MIE1_BACCE/46-349  AC Q4MIE1.1
#=GS Q630Q0_BACCZ/1-304   AC Q630Q0.1
#=GS B9IRY1_BACCQ/1-304   AC B9IRY1.1
#=GS A9VSE6_BACWK/1-304   AC A9VSE6.1
#=GS Q72X99_BACC1/1-304   AC Q72X99.1
#=GS C2X4E1_BACCE/1-304   AC C2X4E1.1
#=GS Q9L4F1_BACCE/1-304   AC Q9L4F1.1
#=GS Q3EZ38_BACTI/39-343  AC Q3EZ38.1
Q4MIE1_BACCE/46-349             MINQKKYVHFVTIYIIIFSLWIFLIPKDLNIKEIGILFLFYFATLFSCYCLYKAIKKMKRGDKLFWVLVLCTCLCGLTMEITLFLHSLSIYDQVIFSYKALPFFIVQYILLFSGFAIKFIKHYSIRGLAQFSFDSIF.IIIMNIYFTLTFILDVSSFFMLTTDTWILIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSSSRISLIIGFTIILVYGYIHMFQLNAGIKPSSEVSYLIHTASILLIGLSSILYILDKPTQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFIIFQPWDDKFMLIGLVLSLILLFLRQ
Q630Q0_BACCZ/1-304              MINQKKYVHFVTMYIIIFSLWIFLIPKDLNIKEIGILFLFCFATLFSCYCLYKAIKKMKRGDKLFWVLVLCTCLCGLTMEITLFLHSLSIYDQVIFSYKALPFFIIQYIFLFSGFAIKFIKHYSIRGLAQFSFDSIF.IVIMNIYFTLTFILDVSNFRMLTIDTWVLIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSSSRISLIIGFTIILVYGYIHLFQLNAGIKPSSEVSYLIHTASILLIGLSSILYILDKPIQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFIIFQPWDDKFMLIGLVLSLILLFLRQ
B9IRY1_BACCQ/1-304              MINQKKYVHFVIMYIIIFSLWIFLIPKDLNIKEIGILFLFCFATIFSCYCLYKAIKKMKRGDKLFWVLVLCTCLCGLTMEITLFLHSLSIYDQVIFSYKALPFFIVQYILLFSGFAIKFIKHYSIRGLAQFSFDSIF.IVIMNIYFTLTFILDISSFRMLTTDTWVLIGYFIAQSLVIYAVISLYRREEYSSSRISLIIGFTIILVYGYIHLFQLNAGIKPSSEVSYLIHTASILLIGLSSILYILDKPIQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFIIFQPWDDKFMLIGLVLSLILLFLRQ
A9VSE6_BACWK/1-304              MINQKKYVHFVMMYIIIFFLWIFLIPKSLNIKEIGILFLFCFATLFSCYCLYKAIKKMKRGDKLFWVLVLCTCLCGLTMEITLFLHSLSIYDQVIFSYKALPFFIVQYILLFSGFAIKFIKHYSIRGLAQFSFDSIF.IVIMNIYFTLTFILDLSSFRMLTTDTWVLIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSSSRISLIIGFTIILVYGYIHLFQLNAGMETSSEVSYLIHTASILLIGLSSILYILDKPMQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFVVIQPWDDKFMLIGLVLSLVLLFLRQ
Q72X99_BACC1/1-304              MINQKKYVHFVMIYIIIFSLWIFLIPKNLNIKEIGILFLFCFAALFSCYCLYKAIKKMKRGDKLFWVLLLCTCLCGLTMEITLFLHSLSIYDQVIFSYTALPFFIVQYILLFSGFAIKFIKHYSIRGLAQFSFDSIF.IIIMNIYFTLTFILDRSSFRMLTTDHWVLIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSASRISLIIGFTIILVYGYIHLFQLNAGMKTSSEVSYLIHTASILLIGLSSILYILDKPMQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFIIFQPWDDKFMLIGLVLSLILLFLRQ
C2X4E1_BACCE/1-304              MINQKKYVQFVMMYIIVFSLWIFLIPNEWNIKEIGILFLFCFAAIFSCYCSYKAIKKMKRGDKLFWVLLLCTCLCGLAMEITLFLHSLSICDQVLFSYEALPFFIIQYILLFSGFAIKFIKHYSIRGLAQFSFDSIF.IVIMNIYFTLTFILDLSSFHTLTKDTWVLIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSSSRISLIIGFTIILVYGYIQLFQLNTGIKTSAEFSYLIHTASILLIGLSSILYILDKPMQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFIIIQPWDDKFMLIGLVLSLILLFLRQ
Q9L4F1_BACCE/1-304              MINQKKYVQFVIIYISIFALWILFIPNESHIKEIGILFLFCFAALFSCHCLYKAIKRMKRSDKLFWILLLCTCLCGLVMEITLFLSSLSIHDQSIFSYKALPFFIIQYILLFVGFAIKFIKNYSIKGLSQFSFDSIF.IIIMNIYFTLTFILDLSSFRMLTKDTWILIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSSSRIALIIGFTIILVYGYIHLFQLNFGMKTSAEINYLIHTASILLIGLSSILYILDKPMQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFIIIQPWDDKFMLIGLVLSLILLFLRQ
Q3EZ38_BACTI/39-343             MINQKKYVQFVIIYISIFALWILFIPNESHIKEIGILFLFCFAALFSCHCLYKAIKKMKRSDKLFWILLLCTCLCGLVMEITLFLSSISMHNQSIFSYKALPFFIIQYILLFVGFAIKFIKNYSIKGLSQFSFDSIFIIIIMNIYFTLTFILDISSFRMLTKDTWILIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSSSRIALIIGFTIILVYGYIHLFQLNFGMKTSAEINYLIHTASILLIGLSSILYILDKPMQHETKAKYYRFDYIRFILPYFSIIITFSFIIIQPWDDKFILIGLVLSLILLFLRQ
#=GC seq_cons                   MINQKKYVHFVhhYIIIFSLWIFLIPK-LNIKEIGILFLFCFAsLFSCYCLYKAIKKMKRGDKLFWVLlLCTCLCGLTMEITLFLHSLSIYDQVIFSYKALPFFIlQYILLFSGFAIKFIKHYSIRGLAQFSFDSIF.IlIMNIYFTLTFILDlSSFRMLTpDTWVLIGYFIAQSLVIYAVISLYRREQYSSSRISLIIGFTIILVYGYIHLFQLNAGhKTSSEVSYLIHTASILLIGLSSILYILDKPMQHETKTKYYRFDYVRFILPYFSIIITFSFIIhQPWDDKFMLIGLVLSLILLFLRQ
//